Specjalistka/Specjalista ds. Multiomiki

Specjalistka/Specjalista ds. Multiomiki

Miejsce pracy: Gdańsk

Osoba spełniająca wymagania weźmie udział w realizacji projektu badawczego-rozwojowego finansowanego ze środków Agencji Badań Medycznych w ramach programu KPO (2024/ABM/03/KPO), pod tytułem "Nowa, multiomiczna, ekonomiczna metoda wcześniejszej diagnostyki raka w oparciu o materiał płynnej biopsji, połączony z zaawansowaną biostatystyką, bioinformatyką i uczeniem maszynowym", kierowanego przez prof. dr hab. Annę Żaczek.

DO ZADAŃ OSOBY ZATRUDNIONEJ NA TYM STANOWISKU BĘDZIE NALEŻAŁO:

• integracja oraz analiza danych pochodzących z różnych technologii omicznych: transkryptomika (mRNA, miRNA, single cell RNA seq), RT-qPCR, metabolomika,
• opracowywanie pipeline'ów analitycznych oraz strategii integracji danych multiomicznych,
• analiza i interpretacja wyników w kontekście biologicznym i klinicznym,
• tworzenie modeli biologicznych i predykcyjnych w oparciu o dane multiomiczne,
• współpraca z bioinformatykiem, biostatystykiem, specjalistą ds. uczenia maszynowego, biologami molekularnymi, klinicystami, technikami laboratoryjnymi oraz studentami zatrudnionymi w projekcie,
• administracja serwerem obliczeniowym wykorzystywanym w analizach multiomicznych, w tym zarządzanie dostępem użytkowników, przechowywaniem i udostępnianiem danych badawczych,
• udział w merytorycznych dyskusjach naukowych oraz w planowaniu eksperymentów,
• przygotowywanie raportów, wizualizacji i podsumowań wyników badań,
• wspieranie procesu publikacji wyników naukowych oraz przygotowywania zgłoszeń patentowych,
• prezentacja rezultatów analiz na spotkaniach projektowych, seminariach i/lub konferencjach naukowych,
• opieka nad studentami i młodszymi członkami zespołu zaangażowanymi w projekt,
• ścisła współpraca z kierownikiem projektu i realizacja powierzonych zadań badawczych.

OD OSÓB KANDYDUJĄCYCH OCZEKUJEMY:

• stopnia naukowego doktora (preferowane kierunki: biotechnologia, bioinformatyka, biologia molekularna, genomika, medycyna molekularna lub pokrewne),
• udokumentowanego dorobku naukowego (publikacje w renomowanych czasopismach międzynarodowych, szczególnie w obszarze analizy danych omicznych lub bioinformatyki),
• doświadczenia w analizie i integracji danych pochodzących z różnych źródeł (np. transkryptomika, proteomika, metabolomika, epigenomika, genomika),
• praktycznej znajomości metod analizy statystycznej, eksploracji danych i modelowania biologicznego,
• umiejętności programowania w językach używanych do analizy danych (np. R, Python, Bash),
• umiejętności opracowywania i wdrażania zautomatyzowanych pipeline'ów analitycznych z wykorzystaniem Snakemake lub Nextflow,
• znajomości zasad powtarzalności analiz bioinformatycznych, w tym kontroli wersji kodu (Git/GitHub) oraz konteneryzacji środowisk w Docker lub Singularity,
• doświadczenia w pracy z systemami operacyjnymi Linux i środowiskami obliczeniowymi (HPC, chmura),
• znajomości zasad bezpiecznego przechowywania i udostępniania danych badawczych,
• ukończonych kursów i szkoleń z zakresu bioinformatyki, analizy danych omicznych lub statystyki (mile widziane certyfikaty potwierdzające kompetencje), a także kurs dot. ochrony danych osobowych,
• znajomości metodologii prowadzenia badań biomedycznych i zasad opracowywania wyników do publikacji,
• wysokiego poziomu motywacji naukowej, samodzielności w planowaniu i prowadzeniu badań,
• umiejętności współpracy w interdyscyplinarnym zespole (bioinformatycy, biolodzy molekularni, klinicyści),
• bardzo dobrej znajomości języka angielskiego w mowie i piśmie.

OFERUJEMY:

• umowę o pracę na okres 3 miesięcy (okres zatrudnienia: r.),
• pracę w uczelni medycznej, która jako jedyna w Polsce posiada status uczelni badawczej,
• dodatkowe wynagrodzenie roczne,
• dofinansowanie do wypoczynku pracownika, tzw. "wczasy pod gruszą",
• dofinansowanie do wypoczynku dzieci,
• dofinansowanie do zajęć sportowo-rekreacyjnych i kulturalno-oświatowych,
• spotkania integracyjne pracowników,
• pożyczki na cele mieszkaniowe,
• dofinansowanie do kart sportowych,
• możliwość przystąpienia do grupowego ubezpieczenia na życie na preferencyjnych warunkach.

ZASADY APLIKOWANIA:

• Osoby zainteresowane prosimy o przesyłanie aplikacji (CV) za pomocą przycisku APLIKUJ.
• Termin nadsyłania aplikacji to r.
• Uprzejmie informujemy, że skontaktujemy się z wybranymi kandydatami.

Obowiązek informacyjny wobec osób ubiegających się o zatrudnienie

Zgodnie z ogólnym rozporządzeniem o ochronie danych z dnia 27 kwietnia 2016 r. zwanym dalej RODO informujemy, iż:

1. Administratorem Pani/Pana danych osobowych jest Gdański Uniwersytet Medyczny z siedzibą w Gdańsku przy ul. M. Skłodowskiej-Curie 3a.

2. Administrator danych osobowych powołał Inspektora Ochrony Danych, z którym można skontaktować się pod numerem telefonu lub adresem e-mail:

3. Pani/Pana dane osobowe przetwarzane będą w celu przeprowadzenia rekrutacji.

4. Podstawą prawną do przetwarzania Pani/Pana danych osobowych jest Kodeks Pracy, art. 221 § 1.

5. Podanie przez Panią/ Pana ww. danych osobowych jest konieczne i jest wymogiem ustawowym.

6. Pani/Pana dane osobowe będą przetwarzane w imieniu administratora danych przez upoważnionych pracowników wyłącznie w celach, o których mowa w ust. 3.

7. Pani/ Pana dane osobowe będą przechowywane przez okres 36 miesięcy.

8. Pani/Pana dane osobowe nie będą udostępniane podmiotom zewnętrznym z wyjątkiem przypadków przewidzianych przepisami prawa.

9. Na zasadach określonych przepisami RODO przysługuje Pani/Panu:

a) prawo dostępu do treści swoich danych,

b) prawo do ich sprostowania, gdy są niezgodne ze stanem rzeczywistym,

c) prawo do ich usunięcia, ograniczenia przetwarzania, a także przenoszenia danych – w przypadkach przewidzianych prawem,

d) prawo do wniesienia sprzeciwu wobec przetwarzania danych,

e) prawo do wniesienia skargi do organu nadzorczego – Prezesa Urzędu Ochrony Danych Osobowych, gdy uzna Pani/Pan, że przetwarzanie Pani/Pana danych osobowych narusza przepisy o ochronie danych osobowych,

f) prawo do cofnięcia zgody w dowolnym momencie bez wpływu na zgodność z prawem przetwarzania, którego dokonano na podstawie zgody przed jej cofnięciem, jeżeli przetwarzanie odbywa się na podstawie zgody.

Information obligation to applicants for employment

In accordance with the General Data Protection Regulation of April 27, 2016, hereinafter referred to as RODO, we inform you that:

1. the controller of your personal data is the Medical University of Gdańsk, based in Gdańsk, M. Skłodowskiej-Curie 3a Street.

2. the Data Controller has appointed a Data Protection Officer, who can be contacted at or e-mail address:

3. Your personal data will be processed for the purpose of recruitment.

4. The legal basis for processing your personal data is the Labor Code, Article 221 § 1.

5. Provision of the above personal data by you is necessary and is a statutory requirement.

6. Your personal data will be processed on behalf of the data controller by authorized employees only for the purposes referred to in paragraph 3.

7. Your personal data will be stored for a period of 36 months.

8. Your personal data will not be shared with external entities except as provided by law.

9. Under the terms of the RODO regulations, you have:

a) the right to access the content of your data,

b) the right to rectify them when they are inconsistent with the actual state,

c) the right to erasure, restriction of processing, as well as data portability - in cases provided by law,

d) the right to object to data processing,

e) the right to lodge a complaint to the supervisory authority - the President of the Office for Personal Data Protection, if you consider that the processing of your personal data violates the provisions on personal data protection,

f) the right to withdraw consent at any time without affecting the legality of the processing carried out on the basis of consent before its withdrawal, if the processing is based on consent.